MULTIVARIATE DENGAN R ++
Input Data
Input Data
Eksplorasi Data
Explorasi Umum
Eksplorasi Klaster
Normalitas
Pilih Var. Respon
Plot
Uji Saphiro-Wilk
Uji Kolmogorov-Smirnov
Uji D'Agustino
Uji Anderson-Darling
Uji Cramer-von Mises
Uji Pearson chi-square
Uji Jarque-Bera
Klaster
Hieraki
Hieraki Data Ekologi
K-Means
PAM
Klaster Clara
Fanny
SOM & SOTA
Berbasis Model (MClust)
Ordinasi
PCA (Interval)
CA (Tabel Kontingensi)
MDS
LDA
HDDA
Bio Diversitas
Input Data Env
Spesies Akumulasi
Lain-lain
MANUAL RINGKAS
INPUT DATA
Pilih Data (Komunitas):
IMPOR
atlas
atya
deug
carniherbi49
GenSim
Pemilu
mouse
rock
Indometh
InsectSprays
Orange
OrchardSprays
ToothGrowth
USArrests
iris
mtcars
trees
DTK(IndpTKontingensi)
DTK2(DpdTKontingensi)
housetasks(TKontingensi)
mite(com)
dune(com)
acre(com)
Choose CSV File
Browse...
Header
Separator
Comma
Semicolon
Tab
Quote
None
Double Quote
Single Quote
Data Lengkap(<15)
Ringkasan Data
Variabel untuk eksplorasi
Data Set
Ringkasan Data Set
Variabel Kuantitatif untuk
Korelasi & Validasi Klaster
Evaluasi Jarak (Data Ekologi)
Jarak
manhattan
euclidean
bray
kulczynski
binomial
canberra
jaccard
gower
altGower
morisita
mountford
cao
Metode Validasi:
internal
stability
Algoritma Klaster:
hierarchical
kmeans
model
pam
sota
fanny
clara
Matriks Korelasi
Diagram Korelasi
Evaluasi Jarak
Skor Optimal
Plot Validasi
Khusus Untuk Histogram
Plot Densitas Emperik
Plot Densitas Teoritis Normal
Mean
Median
QQPlot
BoxPlot
Histogram
KLASTER HIERARKI
Scaled variable
Algoritma
HClust
Diana
Agnes
n-klaster subjek
n-klaster variabel
Jenis-Visual-OPS
dendrogram
circular
layout.auto
layout_with_drl
layout_as_tree
layout.gem
layout.mds
layout_with_lgl
Tautan
single
complete
average
median
centroid
ward.D
ward.D2
Untuk Agnes hanya 'euclidean' atau 'manhattan'
Jarak
euclidean
maximum
manhattan
canberra
binary
minkowski
Jarak
euclidean
maximum
manhattan
canberra
binary
minkowski
Jarak
euclidean
manhattan
Angle
Validasi
internal
stability
Ringkasan
Skor Validasi
Anggota Klaster
DendogramSTD
DendogramOPS
Komparasi STD-OPS
Dendogram 3D (Agnes)
Heatmap
Nilai HM
HIERARKI DATA EKOLOGI
Model ini memberi opsi lebih banyak pada jenis pengukuran jarak
Algoritma
HClust
Diana
AGNES
n-klaster
Tautan
single
complete
average
median
centroid
ward.D
ward.D2
Untuk Agnes hanya 'euclidean' atau 'manhattan'
Jarak
bray
kulczynski
jaccard
gower
altGower
euclidean
manhattan
canberra
morisita
horn
mountford
raup
binomial
chao
Validasi
internal
stability
Ringkasan
Dendogram1
Dendogram2
Plot PCA (Agnes)
Dendogram 3D (Agnes)
Skor Validasi
Klaster K-means
Algoritma
Hartigan-Wong
Lloyd
Forgy
MacQueen
Variabel untuk Detail XY-Plot
n-klaster
Ringkasan
Detail
K-Mean PCA-Viz
Matriks Pencar
Detail XY-Plot
Klaster PAM (Robust KMeans)
Pilih variabel kuantitatif untuk klaster
n-klaster
Metrik
euclidean
manhattan
Ringkasan
Detail Klaster
Matriks Diagram Pencar
Plot Klaster
Klaster CLARA
Pilih variabel kuantitatif untuk klaster
n-klaster
Metrik
euclidean
manhattan
Ringkasan
Detail Klaster
Matriks Diagram Pencar
Plot Klaster
Klaster FUNNY (Fuzzy Clustering)
Pilih variabel kuantitatif untuk klaster
n-klaster
Metrik
euclidean
manhattan
SqEuclidean
Ringkasan Fanny
Detail Fanny
Matriks Pencar
Detail XY-PLot Fanny
Klaster SOTA
Pilih variabel kuantitatif untuk klaster
Metrik (SOTA)
euclidean
correlation
n-Klas (Kohenan-SOM)
Grafik SOTA
Simple Grafik SOM
Grafik Kohenan-SOM
Klaster Berbasis Model (MClust)
Pilih variabel kuantitatif untuk klaster
n-komp
Plot
classification
density
uncertainty
BIC
Ringkasan
Detail Klaster
Matriks PLot Klaster
PCA/ Analisis Komponen Utama
Sebaiknya kerjakan Klaster Hirarki dan Kmean dulu untuk dijadikan tambahan pengelompokan
Detail Output
Pilihan Detail Output Individu
Pilihan pengelompokan (untuk Indiv-Grup-Plot)
PCA Out
Indiv Out Detail
Scree-plot
Var-plot
Indiv-Grup-plot
Indiv-Bi-plot
Var-Dim1
Var-Dim2
Tipe Map Biplot
rowprincipal
colprincipal
symbiplot
rowgab
colgab
rowgreen
colgreen
Vektor Bi-Plot
baris
kolom
keduanya
Gradien Warna
cos2
contrib
coord
x
y
Plot Tabel
Analisis Baris/Kolom
Plot Faktor
Plot SC
Bi-Plot
Plot Detail
Plot
...
...
...
Jarak
manhattan
euclidean
bray
kulczynski
binomial
canberra
jaccard
gower
altGower
morisita
mountford
cao
...
internal
stability
...
hierarchical
kmeans
diana
model
pam
agnes
sota
fanny
clara
Analisis1
Plot
Analisis2
Analisis3
Plot2
Lakukan Analisis Klaster Hirarki dan KMean
Sebelum melakukan Analisis Diskriminan
...
Data Ringkas
Data Lengkap
Analisis
Tab
Tab %
PlotKl
PlotLD
Plot2
Lakukan Analisis Klaster Hirarki dan KMean
Sebelum melakukan Analisis Diskriminan
...
Analisis
Plot
INPUT DATA ENV
Pilih Data Sesuaikan dengan Data Komunitas:
IMPOR
dune(env)
mite(env)
acre(env)
Choose CSV File
Browse...
Header
Separator
Comma
Semicolon
Tab
Quote
None
Double Quote
Single Quote
Data Env Lengkap(<15)
Ringkasan Data Env
ANALISIS Spesies Akumulasi
Metode
exact
collector
random
coleman
rarefaction
SCALE
abundance
proportion
logabun
accumfreq
Spesies Akum
Hasil Akum
Richness Plot
Akum Plot
Rank Plot
MANUAL
PRAKATA
IMPOR DATA
MANUAL